华能药业于1996年创立华能生物技术研究所，根据企业现状及发展的要求组建以下技术创新组织：
（1）核心层专家委员会：由药学专家、临床专家、工程技术专家、科技管理人员、专利专家、金融财务专家共同组成，从技术水平、市场前景、经济效益、项目成熟程度、社会效益、产业基础等多个方面进行项目评估。
（2）技术创新项目小组，由技术负责人、技术依托单位负责人、科技研究人员、市场研究人员、财务人员共同组成的小组，对项目进行全过程管理。
（3）新药报批小组。
（4）外围层加强与浙江大学、中国中医研究院、西苑医院等国内大学及科研机构的合作；加强与国外科研机构、药厂等合作，引进国外先进技术及产品，同时，利用国外企业技术及市场的优势，使中药走出国门。
华能药业的技术创新组织是一个对市场相当敏感的、开放性的研究机构，具有三大特点：
（1）除核心层专家外，外围层合作专家数量庞大
（2）注意信息资源的运用
（3）注意社会研究资源的运用。
华能为提高企业的技术开发创新能力，提高产品科技含量，华能药业与中国中医研究院、北京市临床药物研究所、山东省血栓病研究中心、山东中医药研究所等二十多家科研单位建立了长久的战略开发合作关系，进行了“蚓激酶”针剂、“癌复康”、一类抗菌新药L-17等项目的研究，还与美国高新技术生物公司建立了合作关系，并开展了“高能水”、降糖药物、减肥药物的研究工作，并申请了国家专利，近几年将相继拿到新药证书。
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